Сюжет нового фильма построен вокруг таинственного исчезновения Кевина Флинна, директора компании ENCOM и создателя компьютерной игры «Трон». На поиски отца отправляется его 27-летний сын Сэм Флинн.
Выяснилось, что Флинн-старший оказался в виртуальном мире созданной им игры, и, чтобы его выручить, Сэму тоже необходимо туда попасть. Разобраться с деспотичным миром «Трона» отцу и сыну помогает боевая программа Куорра.